虽然常规的化验、X摄片以及参考病史、体检，可以对肾结石做出诊断。但为了更深一步了解结石的数目、大小、形状、部位，是否伴有梗阻、感染、肾功能衰减等更为具体的信息，患者要是有必要针对肾结石做出确诊。从而保证医生能够给出最为准确的诊疗方案
1、口服1g钙负荷试验
由于甲状旁腺分泌与血钙浓度成反比，正常人输钙后抑制甲状旁腺分泌，尿磷明显减少(20～60%)，血磷明显升高，而患者有甲状旁腺机能亢进输钙后尿磷减少不足20%，而血磷很少改变。
结石含钙愈多，乎片显影愈清楚。含钙少或结石小时则显影不清，甚至模糊看不出。但若在拍片前晚冲服番泻叶6～9g或灌肠后，有可能被检出。纯尿酸结石或胱氨酸结石因不含钙，故平片上不能显示，称为阴性结石，约占全部尿石的3～5%。
2、进行静脉尿路造影
以了解双肾功能、有无积水和整个尿路情况，并为选择治疗提供依据；还能发现引起肾结石的局部病因，如先天性肾盂输尿管联接处狭窄，蹄铁形肾和多囊肾等畸形。在阴性结石可表现为肾盂内占位性变，对碘过敏者和阴性结石患者可行膀胱镜检查与逆行肾盂输尿管造影，必要时行肾盂空气造影。
3、尿路X线平片
鉴别诊断主要是右肾结石引起的上腹痛，须与胆道结石、溃疡病、胰腺炎等疼痛鉴别，但这些病人尿液检查均无红、白细胞。虽然胆道结石或腹腔淋巴结钙化亦可在平片显影，但摄侧位平片，肾结石阴影与腰椎重叠或位于椎体稍后方，而胆道结石或腹腔内淋巴结钙化则位于椎体之前方。尿酸结石患者血尿酸值增高。尿液PH呈持续性强酸性的特点，患者多有痛风病。
