十二指肠是肠子的尾端，上端平第3骶骨上缘平面图，与乙状结肠相接，往下沿骶尾骨曲屈，越过盆体总算齿线，与肛管联接，长12～15cm。十二指肠与乙状结肠相接处最薄，往下扩张成十二指肠壶腹，是肠子最阔一部分，下方又变狭小，产生两边窄小，正中间宽敞。
十二指肠上三分之一的前边以及两边有腹膜后遮住，中三分之一仅在前面有腹膜后，随后在这里翻折成十二指肠膀光陷窝或十二指肠子宫陷窝。腹膜后翻折与肛门口中间间距约7。5cm，在女士则较低。十二指肠后边无腹膜后遮住。
直肠腔肌层由上升下慢慢变厚，贴近肛管时尤其明显。直肠腔分成4层，最内一层称之为粘膜层，是肠壁内；其深面为粘膜下一层，直肠腔外层一层称之为浆膜层，粘膜下一层和浆膜层中间为十二指肠肌层。
十二指肠的肌肉层是直肠腔的更厚一部分，分成环肌和纵肌双层，环肌以内，纵肌出外，纵肌在十二指肠前后左右比在两边稍厚，上连乙状结肠纵肌，下与缩肛肌和内、外扩约相接。环肌肌肉组织在十二指肠上端较少，下边较比较发达，到肛管产生肛门口内扩约。
十二指肠前边在男士与男性前列腺、精囊腺、射精管及膀光紧邻，在女士与阴道内、子宫颈及子宫紧邻，期间借十二指肠膀光肌肉筋膜间隔，因为此肌肉筋膜偏厚，有避免恶变肿瘤初期扩散功效。十二指肠后边有骶骨、尾椎骨、缩肛肌、骶前静脉丛和骶前神经丛，两边有坐骨神经、髂内动脉、腰椎压迫神经及尿道管。