射干的毒副作用主要包括导致滑胎、呕吐以及中毒等。
1、滑胎：因为射干有活血化瘀的作用，而且药效非常强，所以在怀孕期间过多摄入射干，有可能对子宫产生刺激甚至引发宫缩，导致滑胎。
2、 呕吐：因为射干归肝胃经，过量饮用或空腹饮用，可能会对胃肠黏膜产生刺激，甚至引发呕吐的症状。
3、中毒：射干是一种有微量毒性的中草药，一般遵医嘱适量服用，机体可以把毒性免疫掉，不会产生不良的影响，但如果自行加量服药，单纯的靠自身免疫可能没有办法全部过滤掉，就有可能引发中毒的症状，导致病人出现面部瘙痒、红肿等症状，所以用药时，一定要严格遵医嘱按量服用，防止产生不良副作用，对身体健康造成威胁。
射干的作用与功效主要是抑菌消炎，对于皮肤癣菌有一定的抑制作用，另外，跟鸢尾黄酮苷结合，还能起到抗透明质酸酶的作用，起到消炎的功效，对于慢性支气管炎以及咽喉炎等症，有一定的治疗效果。
治疗期间要注意饮食以清淡为主，不能吃辛辣刺激或太油腻的食物。